امامان مدفون در بقیع عبارتند از: امام حسن مجتبی(ع)، امام سجاد(ع)، امام محمد باقر(ع)، و امام جعفر صادق(ع). مرقد آنان در گذشته بارگاه و بقعه‌ای در کنار سایر بقعه‌های بقیع داشت که در ۱۳۴۴ق در جریان تخریب بقیع توسط وهابیان از بین رفته است.
امام محمد بن علی بن حسین بن علی بن ابی طالب مشهور به امام باقر(ع) (۵۷-۱۱۴ق. مدینه)، امام پنجم شیعیان که حدود ۱۹ سال امامت شیعیان را بر عهده داشت و در سال ۱۱۴ قمری به دستور هشام بن عبدالملک مسموم و شهید شد او در قبرستان بقیع، کنار مرقد پدرش امام سجاد(ع) و عموی پدرش حسن بن علی(ع) دفن گردید. و بعد از او فرزندش امام صادق(ع) که در سن 65 سالگی درگذشت، در کنار پدرش به خاک سپرده شد. قبر بالای سر آنها هم قبر عباس عموی پیامبر(ص) است.
در عکس زیر مضجع شریف امام باقر(ع) سومین قبر از سمت چپ (جهت قبله) می باشد.
